RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNIPQ9H3M7 391 aa15.03■□□□□ -0
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.03■□□□□ -0
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa15.03■□□□□ -0
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL9A1P20849 921 aa15.03■□□□□ -0
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -03e-7■□□□□ 8.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B9D1Q9UPM9 204 aa15.02■□□□□ -0
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.02□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAP3P28838 519 aa15.02□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFX2P48378 723 aa15.02□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD300CQ08708 224 aa15.02□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMC4Q5J8M3 183 aa15.02□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC190Q86UF4 302 aa15.02□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.02□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APH1AQ96BI3 265 aa15.02□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN1O95832 211 aa15.01□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATF1P18846 271 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBXA2RP21731 343 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MESP2Q0VG99 397 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CBLN3Q6UW01 205 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PXT1Q8NFP0 134 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SULT1C2O00338 296 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHEP01854 428 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAPPC2P0DI81 140 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PELI1Q96FA3 418 aa15□□□□□ -0.01
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