RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SH3GL1Q99961 368 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CHIAQ9BZP6 476 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.87□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JND7 137 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6C6A6NF89 314 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 PLATP00750 562 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 WNT2P09544 360 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 RAC2P15153 192 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CTLA4P16410 223 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 KDELR2P33947 212 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 PROK1P58294 105 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 GUCY1A3Q02108 690 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OAFQ86UD1 273 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 KLBQ86Z14 1044 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AS1Q8N127 324 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01006Q8NI28 216 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf82Q8WW14 230 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 Q96M85 177 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 WACQ9BTA9 647 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM165Q9HC07 324 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 RHCGQ9UBD6 479 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.86□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS37A4D1T9 235 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 SRRM5B3KS81 715 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 H0YL77 283 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 J3KTA2 159 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNL4K9M1U5 179 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CDC42EP2O14613 210 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 MRASO14807 208 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 FFAR1O14842 300 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CLPXO76031 633 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OPN1MWP04001 364 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CD14P08571 375 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 DBHP09172 617 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 CPT2P23786 658 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA8P32881 189 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR4P46093 362 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC9A3P48764 834 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 PRKCDQ05655 676 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 AQP6Q13520 282 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAM2Q15035 370 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 MESTQ5EB52 335 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 COQ5Q5HYK3 327 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2T2Q6IF00 324 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM122BQ7Z309 247 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 PTP4A1Q93096 173 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEB18Q96M61 343 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 COG8Q96MW5 612 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.85□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WUU8 490 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf63A6NC05 138 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 F5H5P2 479 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 J3QW42 95 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 XKRYO14609 159 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 IMPA2O14732 288 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 RER1O15258 196 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 MLNRO43193 412 aa7.84□□□□□ -1.15
SMARCE1-210ENST00000481231 AHCYL1O43865 530 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms