RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 PLSCR5A0PG75 271 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SURF4O15260 269 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PRODHO43272 600 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 GLCEO94923 617 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 CLPTM1O96005 669 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ADH4P08319 380 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 DAOP14920 347 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF23P17027 643 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 GIFP27352 417 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ALDH3B1P43353 468 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 DAPP51397 102 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 CRISP1P54107 249 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SLC35D3Q5M8T2 416 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PTP4A1Q93096 173 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHA8Q96JA3 519 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 KRT84Q9NSB2 600 aa16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 VWC2LB2RUY7 222 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 NGFP01138 241 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 KITLGP21583 273 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 LINC01590Q5TEZ4 76 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 CORO6Q6QEF8 472 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 COLCA1Q6ZS62 124 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 RDH5Q92781 318 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SPTSSAQ969W0 71 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 MARCH7Q9H992 704 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.19■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 A0A096LNT2 108 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 RAC2P15153 192 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ACHEP22303 614 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 NR4A2P43354 598 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 MMP15P51511 669 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 TPTEP56180 551 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 RIPPLY3P57055 190 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 FBXW12Q6X9E4 464 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SHFQ7M4L6 423 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 OR6K6Q8NGW6 343 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 HAVCR1Q96D42 359 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 TPK1Q9H3S4 243 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 CHODLQ9H9P2 273 aa16.18■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 LY6HO94772 140 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 NAT2P11245 290 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 USF1P22415 310 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 GSTT1P30711 240 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 MPV17P39210 176 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF81P51508 661 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 OTPQ5XKR4 325 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 MAP6Q96JE9 813 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 INTS14Q96SY0 518 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 TOR3AQ9H497 397 aa16.17■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 TVP23AA6NH52 213 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF878C9JN71 531 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 LY6G6DO95868 133 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 APOC1P02654 83 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 GYPBP06028 91 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 DBHP09172 617 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SPARCP09486 303 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ACSM4P0C7M7 580 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SELEP16581 610 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SLC15A1P46059 708 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 TMEM33P57088 247 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PSG7Q13046 419 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SNAPC1Q16533 368 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 DRAM2Q6UX65 266 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF511Q8NB15 262 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 SLC7A6Q92536 515 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 WDR76Q9H967 626 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 DECR2Q9NUI1 292 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 STARD10Q9Y365 291 aa16.16■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 FAM183AA6NL82 134 aa16.15■□□□□ 0.18
SYF2-203ENST00000474160 M0R135 149 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms