RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GAREM1Q9H706 876 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 EXO5Q9H790 373 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 APMAPQ9HDC9 416 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GLTPQ9NZD2 209 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GLS2Q9UI32 602 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.61□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CDC14CA4D256 554 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SMLR1H3BR10 107 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RP2O75695 350 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PNPP00491 289 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 IGHG1P01857 330 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RLN1P04808 185 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 FBXO45P0C2W1 286 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RPA2P15927 270 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RAB3AP20336 220 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CTSSP25774 331 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SELENOPP49908 381 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R31P59538 309 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SLC35A1P78382 337 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CFHR1Q03591 330 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 IL11RAQ14626 422 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR7A5Q15622 319 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZTK2 550 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 COX15Q7KZN9 410 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 UEVLDQ8IX04 471 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TCEAL3Q969E4 200 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 C10orf35Q96D05 121 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OXGR1Q96P68 337 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OPN4Q9UHM6 478 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.6□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPL8 197 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TMEM82A0PJX8 343 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CPED1A4D0V7 1026 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 A6NL46 340 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF726A6NNF4 738 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 B8ZZF3 427 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF878C9JN71 531 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ADAM10O14672 748 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ST8SIA5O15466 376 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SYT7O43581 403 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 DNPH1O43598 174 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SDC3O75056 442 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SCRG1O75711 98 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CRYZL1O95825 349 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CD8AP01732 235 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 IGHEP01854 428 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GIMD1P0DJR0 217 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CLRN1P58418 232 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PMPCAQ10713 525 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CAMK2BQ13554 666 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PPA1Q15181 289 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 EXT1Q16394 746 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 C4orf46Q504U0 113 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 C1orf189Q5VU69 101 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF529Q6P280 563 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OPN5Q6U736 354 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.2 ms