RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF570Q96NI8 536 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 ECSITQ9BQ95 431 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM165Q9HC07 324 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 C1RLQ9NZP8 487 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 RHCGQ9UBD6 479 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.6□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 FBP2O00757 339 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 PHYHO14832 338 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFA7O95182 113 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA14P01570 189 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 MELTFP08582 738 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 DBHP09172 617 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 GPR4P46093 362 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 SLC9A3P48764 834 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 CENPAP49450 140 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 RGS6P49758 472 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS12P56730 875 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 RELBQ01201 579 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 PDCD1Q15116 288 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 MESTQ5EB52 335 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 FITM2Q8N6M3 262 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 OR8G5Q8NG78 346 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 CITED1Q99966 193 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 WACQ9BTA9 647 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 WDR76Q9H967 626 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 NOX4Q9NPH5 578 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 RNF114Q9Y508 228 aa8.59□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 C22orf46C9J442 243 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 MLNRO43193 412 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 HLA-DPB1P04440 258 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SFTPBP07988 381 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CTLA4P16410 223 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CPT2P23786 658 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FPR3P25089 353 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 GZMMP51124 257 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 Q6YL49 198 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 LZICQ8WZA0 190 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RASD2Q96D21 266 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 Q96M85 177 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SH3GL1Q99961 368 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.58□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0G2JND7 137 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS37A4D1T9 235 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OR6C6A6NF89 314 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 J3KTA2 159 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 P2RY10O00398 339 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RER1O15258 196 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SLC16A7O60669 478 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TOX4O94842 621 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TSPAN15O95858 294 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CFHR2P36980 270 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP10-3P60369 221 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TRAM2Q15035 370 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TAF9Q16594 264 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OCLNQ16625 522 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM86BQ8N661 226 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms