RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP5Q16690 384 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 BIVMQ86UB2 503 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF13Q92913 245 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R19P59542 299 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 IL13RA1P78552 427 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZRG5 221 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SYS1Q8N2H4 156 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 AMER3Q8N944 861 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6X1Q8NH79 312 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF596Q8TC21 504 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RSC1A1Q92681 617 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MRI1Q9BV20 369 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CST11Q9H112 138 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 VSIG4Q9Y279 399 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF529Q6P280 563 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 LYG2Q86SG7 212 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CD163Q86VB7 1156 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 SYT4Q9H2B2 425 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 PHYHIPQ92561 330 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MR1Q95460 341 aa7.56□□□□□ -1.2
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