RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 OR2T12Q8NG77 320 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 LIPHQ8WWY8 451 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ASB10Q8WXI3 467 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MPP4Q96JB8 637 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF607Q96SK3 696 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MCHR1Q99705 422 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ARHGDIGQ99819 225 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MSL2Q9HCI7 577 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 NOX4Q9NPH5 578 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 C1RLQ9NZP8 487 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 IL19Q9UHD0 177 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM178BH3BS89 294 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 IFNL4K9M1U5 179 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TIPRLO75663 272 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CLPXO76031 633 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 GPANK1O95872 356 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 HIST1H2ABP04908 130 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CST2P09228 141 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RAP2AP10114 183 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SELEP16581 610 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CCNOP22674 350 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TNFSF4P23510 183 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CDAP32320 146 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 PCGF2P35227 344 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 KRTAP10-3P60369 221 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SCARB2Q14108 478 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ATP6AP1Q15904 470 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 DUSP7Q16829 419 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RABL3Q5HYI8 236 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 Q6ZR03 302 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ABHD4Q8TB40 342 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 FAM162AQ96A26 154 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 C4orf45Q96LM5 186 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CNBD2Q96M20 576 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TSC22D3Q99576 134 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM165Q9HC07 324 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1W2PRG6 482 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 GNGT2O14610 69 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SURF4O15260 269 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 SLC2A10O95528 541 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 CRYBA1P05813 215 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 COX5BP10606 129 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 ARHGDIAP52565 204 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00578-201ENST00000439009 PROK1P58294 105 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms