RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 EMC7Q9NPA0 242 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 FANCFQ9NPI8 374 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCUBQ9NWR8 336 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 HHLA2Q9UM44 414 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 R4GMQ9 66 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCSK5Q92824 1860 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0A6YYH2 397 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1W2PPK0 400 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2QL1A1L167 161 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 A6NJ64 397 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 GJE1A6NN92 205 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMD9O00233 223 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 DVL2O14641 736 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SSNA1O43805 119 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PEX14O75381 377 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHG1P01857 330 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM157BP0CG42 384 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 RCVRNP35243 200 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SOX2P48431 317 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLRN1P58418 232 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSF1Q00613 529 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXF1Q12946 379 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCL2A1Q16548 175 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 MEP1BQ16820 701 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR38Q5JTN6 314 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX30Q5JUR7 227 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM205Q6UW68 189 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35D2Q76EJ3 337 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 UEVLDQ8IX04 471 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR5H6Q8NGV6 325 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 HGDQ93099 445 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSSK2Q96PF2 358 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASF1BQ9NVP2 202 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYOTQ9UBF9 498 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 UPB1Q9UBR1 384 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLEQ07864 2286 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0B4J293 547 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GUH1 482 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS44E7EML9 344 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SULT1C2O00338 296 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC17A2O00624 439 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAS1P04201 325 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD3GP09693 182 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 H2BFMP0C1H6 154 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 DPP4P27487 766 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSD11B1P28845 292 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms