RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM77	I1YAP6	450 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PLPP2	O43688	288 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10H3	O60404	316 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DBH	P09172	617 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RRM2	P31350	389 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A6	P31641	620 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MEP1B	Q16820	701 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf89	Q6UX73	402 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PTP4A1	Q93096	173 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CMBL	Q96DG6	245 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD8	Q96LT4	415 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NMNAT3	Q96T66	252 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ7	Q99807	217 aa		14.98	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTN3	O75935	186 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	AVP	P01185	164 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RAC2	P15153	192 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS6	P49758	472 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERF	P50548	548 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGA2	P52926	109 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HILS1	P60008	231 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	COX10	Q12887	443 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LEG1	Q6P5S2	330 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GJC3	Q8NFK1	279 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NDE1	Q9NXR1	346 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	NPTN	Q9Y639	398 aa		14.97	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IDH3B	O43837	385 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	REN	P00797	406 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV2-70	P01814	119 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNGR2	P38484	337 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPAN31	Q12999	210 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX29	Q8N6K0	151 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4K13	Q8NH42	304 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	JMJD8	Q96S16	334 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GAL3ST1	Q99999	423 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IFT27	Q9BW83	186 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	IL19	Q9UHD0	177 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		14.96	□□□□□ -0.01
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0G2JMP0	313 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0X1KG70	313 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6C68	A6NDL8	312 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT36	O76013	467 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF1A	P19438	455 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFSF4	P23510	183 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEA2	P43356	314 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CORO6	Q6QEF8	472 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DDO	Q99489	341 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		14.95	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ISPD	A4D126	451 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738		J3QLI3	93 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	EPHA1	P21709	976 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GATA3	P23771	443 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPA	P49450	140 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	FITM2	Q8N6M3	262 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2V2	Q96R30	315 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		14.94	□□□□□ -0.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		14.94	□□□□□ -0.02

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