RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf189Q5VU69 101 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DCXRQ7Z4W1 244 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 R4GMQ9 66 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 D6RAR5 112 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 AHSA1O95433 338 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GIMD1P0DJR0 217 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 FSTP19883 344 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC22AQ96IW7 307 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCD10Q9BUL8 212 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SCPEP1Q9HB40 452 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5H14A6NHG9 310 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LILRA5A6NI73 299 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 HPP00738 406 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CFIP05156 583 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS19P49795 217 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SHBQ15464 509 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 BEX5Q5H9J7 111 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ST8SIA2Q92186 375 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQD3 144 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC5O15389 551 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF823P16415 610 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CD34P28906 385 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF7P61962 342 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CLVS2Q5SYC1 327 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LIN54Q6MZP7 749 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CORO6Q6QEF8 472 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR119Q8TDV5 335 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf72A6NCS6 295 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY10O00398 339 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CRABP1P29762 137 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF13Q15543 124 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CMBLQ96DG6 245 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NPAS1Q99742 590 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPMQ9NSP4 180 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LDLRAD4O15165 306 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A5P58743 744 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CDNFQ49AH0 187 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GRINAQ7Z429 371 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PXT1Q8NFP0 134 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 VSIG4Q9Y279 399 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 APOC3P02656 99 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MGMTP16455 207 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LYSMD4Q5XG99 296 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf33Q6P1S2 294 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB13Q8WXK3 278 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DNASE2BQ8WZ79 361 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM46BQ96A09 425 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MEGF11A6BM72 1044 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GDF9O60383 454 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CD74P04233 296 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 FOLR1P15328 257 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 AGTR1P30556 359 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB8AQ96BR9 441 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 UBBP0CG47 229 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 UBA52P62987 128 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CXADRP78310 365 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A6Q4U2R8 563 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TFAP2EQ6VUC0 442 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST4Q8NCG5 386 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A10Q8NG04 563 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms