RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 RBP2P50120 134 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 EXD3Q8N9H8 876 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 MYADML2A6NDP7 307 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 J3QR89 54 aa8.93□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.93□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 PPP1R1AQ13522 171 aa8.93□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 MPPED2Q15777 294 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.93□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 H0YGG7 62 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 TMPRSS11DO60235 418 aa8.92□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 TECTBQ96PL2 329 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 OPRM1P35372 400 aa8.92□□□□□ -0.98
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HERC3-202ENST00000402738 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 LPAR4Q99677 370 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 SEC11CQ9BY50 192 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 GFYI3L273 518 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 DVL1O14640 695 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 PMCHP20382 165 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 RAB38P57729 211 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 SRYQ05066 204 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 KCNAB1Q14722 419 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 TMEM104Q8NE00 496 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 MR1Q95460 341 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 IL22RA2Q969J5 263 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 KLKB1P03952 638 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 TBPP20226 339 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-202ENST00000402738 HOXC8P31273 242 aa8.91□□□□□ -0.98
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