RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395740.5

FGD4-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FGD4, Length 2,691 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4-201ENST00000395740 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 MELKQ14680 651 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ARL6IP1Q15041 203 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 PPA1Q15181 289 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 DEFB134Q4QY38 66 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 MESTQ5EB52 335 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZNF529Q6P280 563 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 BTNL8Q6UX41 500 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZAR1Q86SH2 424 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 FRMD1Q8N878 549 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 HMGB4Q8WW32 186 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 C8orf44Q96CB5 159 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZNF75AQ96N20 296 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RNF126Q9BV68 326 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 GPR174Q9BXC1 333 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 TLNRD1Q9H1K6 362 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CERS4Q9HA82 394 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 GDE1Q9NZC3 331 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 IKZF2Q9UKS7 526 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 B9D1Q9UPM9 204 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 KCNK6Q9Y257 313 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 MEMO1Q9Y316 297 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 R4GMQ9 66 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.56□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 A0A0J9YY10 115 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 H0YGG7 62 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RAB27BO00194 218 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 STK17BO94768 372 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 AKR7A3O95154 331 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 SFT2D2O95562 160 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 IL33O95760 270 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 BGLAPP02818 100 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 FCGR3AP08637 254 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 SPP1P10451 314 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CRABP1P29762 137 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 IGFALSP35858 605 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 AQP2P41181 271 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 GPR3P46089 330 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 FNTBP49356 437 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 AKR1D1P51857 326 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 F2RL1P55085 397 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 QRFPP83859 136 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZP4Q12836 540 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 PPP1R1AQ13522 171 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 SGCBQ16585 318 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RTL6Q6ICC9 239 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 OR4N5Q8IXE1 308 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZNF519Q8TB69 540 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 C2orf50Q96LR7 162 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 TSPAN32Q96QS1 320 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 LPAR4Q99677 370 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ARV1Q9H2C2 271 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RHOFQ9HBH0 211 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 KLK13Q9UKR3 277 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 GPR132Q9UNW8 380 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 MPDZO75970 2070 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 PRSS38A1L453 326 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 OR10H2O60403 315 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 FADS1O60427 444 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 IGHV2-5P01817 119 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CT45A8P0DMV1 189 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CT45A9P0DMV2 189 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 SELLP14151 372 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 FOSL2P15408 326 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 FPR2P25090 351 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ABCD3P28288 659 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 ADH6P28332 368 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 CCKBRP32239 447 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 RAB5CP51148 216 aa4.55□□□□□ -1.68
FGD4-201ENST00000395740 PGDP52209 483 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms