RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 OR10A4Q9H209 315 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GUH1 482 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CDC42EP2O14613 210 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TO15178 435 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 XRCC2O43543 280 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF254O75437 659 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SCGB1D2O95969 90 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CELA3AP09093 270 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GLRA1P23415 457 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 STOMP27105 288 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LIMK1P53667 647 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SSX6Q7RTT6 188 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC35B4Q969S0 331 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SYT3Q9BQG1 590 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PLK3Q9H4B4 646 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IL20Q9NYY1 176 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 COPZ2Q9P299 210 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NUP50Q9UKX7 468 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SIP14410 1827 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZAR1LA6NP61 321 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TNFRSF1AP19438 455 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MPGP29372 298 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PRSS3P35030 304 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RBP2P50120 134 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 AKR1C2P52895 323 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 APOOLQ6UXV4 268 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 KCTD9Q7L273 389 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HPS1Q92902 700 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR5M11Q96RB7 305 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C12orf10Q9HB07 376 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM100Q9NV29 134 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PLXNA3P51805 1871 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FUOMA2VDF0 154 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NRASP01111 189 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RAB14P61106 215 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR176Q14439 515 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ETFDHQ16134 617 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC107Q8WV48 283 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ISOC1Q96CN7 298 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR6C68A6NDL8 312 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 AQP7P3A6NL99 342 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 L7N2F9 121 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GABRPO00591 440 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ARPC3O15145 178 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FADS1O60427 444 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MPZL1O95297 269 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LPLP06858 475 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF17P17021 662 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CHRNB4P30926 498 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TGM4P49221 684 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 VEGFCP49767 419 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 BMXP51813 675 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 VAMP2P63027 116 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TBR1Q16650 682 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR6X1Q8NH79 312 aa6.28□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms