RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 CLDN15P56746 228 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 STUMQ69YW2 141 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 C14orf79Q96F83 325 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CMTM3Q96MX0 182 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LYSMD1Q96S90 227 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 NT5DC2Q9H857 520 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 OR2M7Q8NG81 312 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CCL17Q92583 94 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MED29Q9NX70 200 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 F5H697 171 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 B4GALT1P15291 398 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 RHOBP62745 196 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ACTBL2Q562R1 376 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TEX37Q96LM6 180 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 C12orf10Q9HB07 376 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MARCH5Q9NX47 278 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 BTAF1O14981 1849 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 IDSB3KWA1 339 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 COX7A2P2O60397 106 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CTNSO60931 367 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NRASP01111 189 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 PFN3P60673 137 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 ZBP1Q9H171 429 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 AK3Q9UIJ7 227 aa9.64□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 SULT1C4O75897 302 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR2C1O95371 312 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GLAP06280 429 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ADH4P08319 380 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PXT1Q8NFP0 134 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GPANK1O95872 356 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CRYAAP02489 173 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 EMDP50402 254 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GFERP55789 205 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 YIPF5Q969M3 257 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 STACQ99469 402 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MS4A8Q9BY19 250 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PLPP1O14494 284 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CCL2P13500 99 aa9.63□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SPTBP11277 2137 aa9.63□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 PRRT4C9JH25 899 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CXCL13O43927 109 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KLKB1P03952 638 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LSAMPQ13449 338 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 DHRS13Q6UX07 377 aa9.63□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.63□□□□□ -0.87
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