RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CDONQ4KMG0 1287 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5AS1Q8N127 324 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf82Q8WW14 230 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPHS2Q99611 448 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF7Q9UBF6 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NIZ1 184 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 EVPLLA8MZ36 301 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BUI4 141 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS8O00214 317 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 BIRC5O15392 142 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SGCEO43556 437 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG7O75391 227 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A10O95528 541 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDOBP05062 364 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 F13BP05160 661 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PF4V1P10720 104 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 FPR3P25089 353 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA8P32881 189 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ETV4P43268 484 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 GATA4P43694 442 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT2B15P54855 530 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RAP1BP61224 184 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RAP1AP62834 184 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 COX10Q12887 443 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NXNQ6DKJ4 435 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZR03 302 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8TCH9 128 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MAL2Q969L2 176 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NABP1Q96AH0 204 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX37Q96LM6 180 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 B9D2Q9BPU9 175 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRPDQ9H106 197 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MEIOCA2RUB1 952 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C6A6NF89 314 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 NPFFO15130 113 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT34O76011 436 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QCP02747 245 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 PF4P02776 101 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-ND1P03886 318 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SHBGP04278 402 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 FUT1P19526 365 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 CD247P20963 164 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC1A6P48664 564 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 COL10A1Q03692 680 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSM1Q08AH1 577 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 MALLQ13021 153 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP6Q13520 282 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SCARB2Q14108 478 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG10Q5BKT4 473 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T2Q6IF00 324 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.48□□□□□ -1.37
PGGT1B-201ENST00000296642 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.48□□□□□ -1.37
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