RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 KNG1P01042 644 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SFTPBP07988 381 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SLC35E2P0CK97 266 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 RPA2P15927 270 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 MGMTP16455 207 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 GPX8Q8TED1 209 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 STK17BO94768 372 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZNF806P0C7X5 589 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 CXCR1P25024 350 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZNF117Q03924 483 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 23.2
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SNX1-201ENST00000261889 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 C9JQL5 133 aa11.63□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 ADAM10O14672 748 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 UTS2O95399 124 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ITGB2P05107 769 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ABOP16442 354 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TAS2R19P59542 299 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 PRPS1P60891 318 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 HHEXQ03014 270 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SLC17A1Q14916 467 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 OTOSQ8NHW6 89 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TGM7Q96PF1 710 aa11.63□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.63□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 LINC00587B1AMM8 73 aa11.63□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 CEBPGP53567 150 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 PNLIPRP2P54317 469 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 FOXK1P85037 733 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 KIR2DS3Q14952 304 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TMEM104Q8NE00 496 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 MCHR2Q969V1 340 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.63□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.63□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 ZNF749O43361 778 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 BCL2L11O43521 198 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SCGB1D2O95969 90 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZNF735P0CB33 412 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SPINK2P20155 84 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 CDAP32320 146 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 TMEM17Q86X19 198 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ARL5BQ96KC2 179 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 FANCFQ9NPI8 374 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 OBP2AQ9NY56 170 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 RFNGQ9Y644 331 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 A0A1W2PPE3 182 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 FAM221BA6H8Z2 402 aa11.62□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 C2orf74A8MZ97 194 aa11.62□□□□□ -0.55
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