RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 ABHD6Q9BV23 337 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 BLACEA4D250 179 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC25A12O75746 678 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CD2P06729 351 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ADAM8P78325 824 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PRR22Q8IZ63 422 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ADOQ96SZ5 270 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 HPF1Q9NWY4 346 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ASXL3Q9C0F0 2248 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SULT2B1O00204 365 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR6A2O95222 327 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 RIDAP52758 137 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 HSD17B7P56937 341 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC37A1P57057 533 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PPP1R1AQ13522 171 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC25A42Q86VD7 318 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 GUCD1Q96NT3 240 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LAT2Q9GZY6 243 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CST11Q9H112 138 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ICOSLGO75144 302 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CASRP41180 1078 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LYG2Q86SG7 212 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 JAGN1Q8N5M9 183 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR1S2Q8NGQ3 325 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 NUDT9Q9BW91 350 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PCDHB10Q9UN67 800 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.09■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 LOC100509620A0A075B734 347 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 HLA-GP17693 338 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CXCR1P25024 350 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PPICP45877 212 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 SKP1P63208 163 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ACBD4Q8NC06 268 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 OR5T2Q8NGG2 359 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 PIGMQ9H3S5 423 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 GAREM1Q9H706 876 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 TMED7Q9Y3B3 224 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa22.08■■□□□ 1.13
LMO2-201ENST00000257818 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 HCRTR2O43614 444 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 LMX1BO60663 402 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 ATG12O94817 140 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 SQSTM1Q13501 440 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 ZNF584Q8IVC4 421 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 SLC25A45Q8N413 288 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 OR4D6Q8NGJ1 314 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 SLC2A8Q9NY64 477 aa22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 A0A0A6YYH2 397 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 A6NJ64 397 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 DISC1C4P0D8 188 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 SIGLEC6O43699 453 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 MPZL1O95297 269 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 IL2RAP01589 272 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 BDKRB2P30411 391 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 CXADRP78310 365 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 LYPD6Q86Y78 171 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 OIT3Q8WWZ8 545 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 AQP3Q92482 292 aa22.07■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 KCNAB3O43448 404 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 AVPR2P30518 371 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 BIKQ13323 160 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 CDNFQ49AH0 187 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 OR13C3Q8NGS6 347 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 RELTQ969Z4 430 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 EMC9Q9Y3B6 208 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 FREM3P0C091 2139 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 C9orf170A2RU37 121 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 FAM25EA8MYX2 175 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 GPR31O00270 319 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 DNASE1L1P49184 302 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 MEF2DQ14814 521 aa22.06■■□□□ 1.12
LMO2-201ENST00000257818 SGCBQ16585 318 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms