RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	VAMP5	O95183	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	IL6	P05231	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TACSTD2	P09758	323 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	GIF	P27352	417 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	AQP1	P29972	269 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SOX2	P48431	317 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	HMGA2	P52926	109 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CDH15	P55291	814 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SQLE	Q14534	574 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	RGN	Q15493	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ITCH	Q96J02	903 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	AIM2	O14862	343 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TPST2	O60704	377 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CCL2	P13500	99 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF35	P13682	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	IDO1	P14902	403 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ARR3	P36575	388 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	VAMP2	P63027	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A087WUJ7	227 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A096LPI6	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658		A6NLC8	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658		M0R233	179 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	UBD	O15205	165 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	BGLAP	P02818	100 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	AHCY	P23526	432 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MFSD8-240	ENST00000641658	MAGEB1	P43366	347 aa		4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms