RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FGGY	Q96C11	551 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SHD	Q96IW2	340 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RBP7	Q96R05	134 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	EXO5	Q9H790	373 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPL8	197 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL2	P19875	107 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	H2BFS	P57053	126 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ACY1	Q03154	408 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MYBPH	Q13203	477 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RGS11	O94810	467 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IFNA7	P01567	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CDA	P32320	146 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SFTPD	P35247	375 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		K7ESF4	209 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GOSR2	O14653	212 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IL5	P05113	134 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FOSL2	P15408	326 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PTGS2	P35354	604 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	NUBPL	Q8TB37	319 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CMBL	Q96DG6	245 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MYOT	Q9UBF9	498 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		L7N2F9	121 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ARPC5	O15511	151 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RAB3D	O95716	219 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SLC2A1	P11166	492 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF35	P13682	527 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MFAP5	Q13361	173 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OPCML	Q14982	345 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	WNT16	Q9UBV4	365 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF28	P17035	718 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ZP4	Q12836	540 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54

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