RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 HTR5AP47898 357 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CXCR4P61073 352 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CSNK2BP67870 215 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ACTC1P68032 377 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ACTA1P68133 377 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PLP2Q04941 152 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 RAB39AQ14964 217 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 RAB35Q15286 201 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.41□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.41□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 OR2T27Q8NH04 317 aa7.41□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.41□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 COPS4Q9BT78 406 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD6Q9BV23 337 aa7.41□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 PSMD9O00233 223 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PHYHO14832 338 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV3-15P01624 115 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 CCDC159P0C7I6 412 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 CCL2P13500 99 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 IGFBP2P18065 325 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ALOX5APP20292 161 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CCNOP22674 350 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PAX7P23759 505 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SSX8Q7RTT4 187 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SSX6Q7RTT6 188 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.4□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF75AQ96N20 296 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 DACH2Q96NX9 599 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ATF6BQ99941 703 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.4□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf49A4QMS7 147 aa7.39□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR6C6A6NF89 314 aa7.39□□□□□ -1.23
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