RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	CD24	P25063	80 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	TAF11	Q15544	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-222	ENST00000626061	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061		F5H5P2	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061		H3BS24	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	UPK1A	O00322	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SCN2B	O60939	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4F21	O95013	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NKX2-2	O95096	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA4L	O95757	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	APOC2	P02655	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	POU1F1	P28069	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MPI	P34949	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	P2RY4	P51582	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ACTB	P60709	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	GALE	Q14376	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF212	Q495C1	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RCN3	Q96D15	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RHOV	Q96L33	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	BPNT1	O95861	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SCG5	P05408	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	EPOR	P19235	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	STOM	P27105	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA7	P48741	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	MIER2	Q8N344	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-222	ENST00000626061	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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