RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613922.1

CCL3-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3, Length 778 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-204ENST00000613922 CDRT15Q96T59 188 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ARPC3O15145 178 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 IGHV2-5P01817 119 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ANPEPP15144 967 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 FPR3P25089 353 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 CRABP1P29762 137 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 GNGT1P63211 74 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 RFX4Q33E94 735 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 OTPQ5XKR4 325 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 FANK1Q8TC84 345 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 RAB1CQ92928 201 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 RAB39BQ96DA2 213 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 TIMD4Q96H15 378 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 RERGLQ9H628 205 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 MSL2Q9HCI7 577 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 STARD10Q9Y365 291 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3-204ENST00000613922 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 J3QW42 95 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DCTN6O00399 190 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 PPP1R3DO95685 299 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 FABP3P05413 133 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 SLC6A6P31641 620 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 GSSP48637 474 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 GYS2P54840 703 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 HIST1H3AP68431 136 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 SLC3A1Q07837 685 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 SPATS1Q496A3 300 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 SPRNQ5BIV9 151 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 LIPNQ5VXI9 398 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 SLC7A6Q92536 515 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 CCL17Q92583 94 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 HAVCR1Q96D42 359 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 COG8Q96MW5 612 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 TSSK2Q96PF2 358 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 OR52D1Q9H346 318 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.52□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 RER1O15258 196 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 TCF21O43680 179 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 RRM2P31350 389 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 RGS6P49758 472 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 C16orf89Q6UX73 402 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 Q6ZR03 302 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 PTP4A1Q93096 173 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 CMBLQ96DG6 245 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 NDE1Q9NXR1 346 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 METRNQ9UJH8 293 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 B9D1Q9UPM9 204 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 PLPP2O43688 288 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 OR10H3O60404 316 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DCTN3O75935 186 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 GPANK1O95872 356 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 PNPP00491 289 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DBHP09172 617 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 IFNGR2P38484 337 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 LEG1Q6P5S2 330 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 OR6V1Q8N148 313 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 GJC3Q8NFK1 279 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 SAMD8Q96LT4 415 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 NMNAT3Q96T66 252 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 COQ7Q99807 217 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 IDH3BO43837 385 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 RENP00797 406 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 RAC2P15153 192 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 TNFSF4P23510 183 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL3-204ENST00000613922 ERFP50548 548 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms