RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC17A5Q9NRA2 495 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 UBL3O95164 117 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM157CP0CG43 387 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ENTPD1P49961 510 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 NR1H2P55055 460 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP5J2P56134 94 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM27E3Q08E93 113 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC36A2Q495M3 483 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SHFQ7M4L6 423 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM171Q8WVE6 324 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT11O96014 354 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TFP02787 698 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF91Q05481 1191 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 AQP6Q13520 282 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PCK2Q16822 640 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL22Q53GT1 634 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A14Q7RTX9 510 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC16A9Q7RTY1 509 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TIGD4Q8IY51 512 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF511Q8NB15 262 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 HS3ST6Q96QI5 342 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC14L2O76054 403 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB40BQ12829 278 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD17B8Q92506 261 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 REG4Q9BYZ8 158 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A096LPE4 126 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PPZ6 126 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TVP23AA6NH52 213 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SBK2P0C263 348 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC159P0C7I6 412 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CCKARP32238 428 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ARR3P36575 388 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC12BQ2HXU8 276 aa20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-214ENST00000592483 MUCL1Q96DR8 90 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 RNFT2Q96EX2 444 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MED18Q9BUE0 208 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 C19orf24Q9BVV8 132 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR76Q9H967 626 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRL4Q9HBW9 690 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 EMC7Q9NPA0 242 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 AASSQ9UDR5 926 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 CR1P17927 2039 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MPZL1O95297 269 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 GPANK1O95872 356 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PIPP12273 146 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V1E1P36543 226 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC18Q8N456 261 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SH3GL3Q99963 347 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SCN3BQ9NY72 215 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 PHYHO14832 338 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SCG5P05408 212 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 LOXP28300 417 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC15A1P46059 708 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 NUDT6P53370 316 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTC1P68032 377 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 ACTA1P68133 377 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-214ENST00000592483 TSC22D1Q15714 1073 aa20.49■□□□□ 0.87
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