RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SGCEO43556 437 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 GPANK1O95872 356 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MDKP21741 143 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OTPQ5XKR4 325 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf94Q6P1W5 598 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ERICH5Q6P6B1 374 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf139Q6ZV77 190 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf82Q8WW14 230 aa21.49■■□□□ 1.03
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CAPNS1-211ENST00000590874 SURF4O15260 269 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF205O95201 554 aa21.48■■□□□ 1.03
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CAPNS1-211ENST00000590874 YAP1P46937 504 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MTNR1AP48039 350 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OAFQ86UD1 273 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AS1Q8N127 324 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 UPRTQ96BW1 309 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SLITRK2Q9H156 845 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 IL20RAQ9UHF4 553 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV40A0A0B4J280 105 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JND7 137 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB9A8MZ26 197 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIAL4GP0DN37 164 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 KDELR2P33947 212 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCY1A3Q02108 690 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCDQ05655 676 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MESTQ5EB52 335 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10AD1Q8NGE0 317 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB18Q96M61 343 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 J3KTA2 159 aa21.46■■□□□ 1.03
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OMGP23515 440 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 BTNL3Q6UXE8 466 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRN1Q6UXK5 716 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 KLBQ86Z14 1044 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PTP4A1Q93096 173 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TMIGD2Q96BF3 282 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-211ENST00000590874 MEGF10Q96KG7 1140 aa21.46■■□□□ 1.03
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM220BPB1ANY3 271 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 MRASO14807 208 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 CTLA4P16410 223 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOWP63302 87 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP6Q13520 282 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKDD1AQ495B1 522 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATC1Q76KD6 591 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 COG8Q96MW5 612 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 PTTG3PQ9NZH4 202 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 GRHPRQ9UBQ7 328 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42EP2O14613 210 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 MIDNQ504T8 468 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T2Q6IF00 324 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf87Q6PH81 154 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM122BQ7Z309 247 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC11Q9BVV2 318 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-211ENST00000590874 H0YL77 283 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNL4K9M1U5 179 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 CD14P08571 375 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A3P48764 834 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAM2Q15035 370 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 TBPL2Q6SJ96 375 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.43■■□□□ 1.02
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