RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.53□□□□□ -0.72
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GGA3-217ENST00000583667 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
GGA3-217ENST00000583667 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.53□□□□□ -0.72
GGA3-217ENST00000583667 MMP27Q9H306 513 aa10.53□□□□□ -0.72
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GGA3-217ENST00000583667 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.53□□□□□ -0.72
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GGA3-217ENST00000583667 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.52□□□□□ -0.73
GGA3-217ENST00000583667 ZNF175Q9Y473 711 aa10.52□□□□□ -0.73
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GGA3-217ENST00000583667 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.51□□□□□ -0.73
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GGA3-217ENST00000583667 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GGA3-217ENST00000583667 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
GGA3-217ENST00000583667 RBPJQ06330 500 aa10.5□□□□□ -0.73
GGA3-217ENST00000583667 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
GGA3-217ENST00000583667 MEP1BQ16820 701 aa10.5□□□□□ -0.73
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