RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 PPP1R3DO95685 299 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 NGFP01138 241 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CDH15P55291 814 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SLC3A1Q07837 685 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 LEG1Q6P5S2 330 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 YIPF5Q969M3 257 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HDHD2Q9H0R4 259 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ASH2LQ9UBL3 628 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 B9D1Q9UPM9 204 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.48■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ANPEPP15144 967 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 IGFBP5P24593 272 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 MPV17P39210 176 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HFEQ30201 348 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 FAM120AOSQ5T036 256 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 PTP4A1Q93096 173 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 TIMD4Q96H15 378 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SAMD8Q96LT4 415 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 IL20Q9NYY1 176 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.47■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CCNB2O95067 398 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CD55P08174 381 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SRD5A1P18405 259 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ATP6V1B2P21281 511 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 KITLGP21583 273 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 CENPAP49450 140 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HIST1H3AP68431 136 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 COX10Q12887 443 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ECH1Q13011 328 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 TRIP10Q15642 601 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 OR6V1Q8N148 313 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 RAB1CQ92928 201 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 ASB9Q96DX5 294 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 LRGUKQ96M69 825 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 NMNAT3Q96T66 252 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 COQ7Q99807 217 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.46■□□□□ 0.07
COMMD4-218ENST00000567377 TCRBV5S2A0A599 114 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CLDN25C9JDP6 229 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 MPZL1O95297 269 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 IGHV1-46P01743 117 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 T-ENOLP0DO92 83 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GAAP10253 952 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RAC2P15153 192 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TNFSF4P23510 183 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PSG7Q13046 419 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 USP51Q70EK9 711 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR4K13Q8NH42 304 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 HAVCR1Q96D42 359 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SOX7Q9BT81 388 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 REEP1Q9H902 201 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 DCTN6O00399 190 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RER1O15258 196 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SURF4O15260 269 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SPRY3O43610 288 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CDC14BO60729 498 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RAP2AP10114 183 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 IL2RGP31785 369 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CDK5R2Q13319 367 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CR1LQ2VPA4 569 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RINLQ6ZS11 566 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SLC26A10Q8NG04 563 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR2T29Q8NH02 315 aa15.44■□□□□ 0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SPATA3Q8NHX4 192 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms