RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 LINGO2Q7L985 606 aa18.01■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 SIAH3Q8IW03 269 aa18.01■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G3Q9NZ20 509 aa18■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 CKLFQ9UBR5 152 aa18■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 RNF133Q8WVZ7 376 aa17.99■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 OR52A1Q9UKL2 312 aa17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXL3Q9UKT7 428 aa17.99■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa17.99■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZFP69Q49AA0 526 aa17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM69Q5SWH9 247 aa17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 GALNT16Q8N428 558 aa17.99■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PPL8 197 aa17.98■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 H0YC42 278 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 GABARAPH6UMI1 98 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 PMS2P2O95744 297 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 ISG15P05161 165 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 RAET1LQ5VY80 246 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 CORO6Q6QEF8 472 aa17.98■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 G6PC2Q9NQR9 355 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 COPZ2Q9P299 210 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 DCDC2BA2VCK2 349 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2M5A3KFT3 312 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 A6NL46 340 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF726A6NNF4 738 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 TPPPO94811 219 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 ARSBP15848 533 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 ACHEP22303 614 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 GDNFP39905 211 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 FOXO1Q12778 655 aa17.98■□□□□ 0.47
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PACSIN3-211ENST00000539589 AUNIPQ9H7T9 357 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 CNR1P21554 472 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK2P24941 298 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 MNDAP41218 407 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 PTH2RP49190 550 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM244Q5VVB8 128 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 MTFR2Q6P444 385 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 FCAMRQ8WWV6 532 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 SLAMF6Q96DU3 332 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC61A2Q9H9S3 476 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNA1CQ13936 2221 aa17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3-211ENST00000539589 FRYQ5TBA9 3013 aa17.96■□□□□ 0.47
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