RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COMTD1Q86VU5 262 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR25Q96S07 402 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C12orf10Q9HB07 376 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENONQ9NZV5 590 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.28□□□□□ -1.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KPTNQ9Y664 436 aa8.28□□□□□ -1.08
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PPM1 405 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR91A4D1P6 747 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBP2O00757 339 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM20BO75063 409 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLIC3O95833 236 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ETFAP13804 333 aa8.27□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRISP3P54108 245 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DGCR2P98153 550 aa8.27□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.27□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR6S1Q8NH40 331 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTP4A1Q93096 173 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NABP1Q96AH0 204 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PANX1Q96RD7 426 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.27□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLIN3O60664 434 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ICMTO60725 284 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FSTL3O95633 263 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A6Q92536 515 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM19Q96HH6 336 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.26□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CALML5Q9NZT1 146 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT52Q9Y366 437 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.26□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.25□□□□□ -1.09
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGALS8O00214 317 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN12O43309 604 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UMPSP11172 480 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FPR3P25089 353 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCALDP61601 193 aa8.25□□□□□ -1.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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