RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521760.1

IGHVII-49-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-49-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-49-1, Length 224 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 NPY4RP50391 375 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ERFP50548 548 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 UGT2B15P54855 530 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 CDK6Q00534 326 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 FMODQ06828 376 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 COX10Q12887 443 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 FADDQ13158 208 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 OR2T2Q6IF00 324 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 LYG1Q8N1E2 194 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SMYD1Q8NB12 490 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 COG8Q96MW5 612 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 RBP7Q96R05 134 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SEPHS2Q99611 448 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SIRPDQ9H106 197 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PPA2Q9H2U2 334 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TOR3AQ9H497 397 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.04□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 GMNCA6NCL1 334 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 F5H5P2 479 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 FBP1P09467 338 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 BMP2P12643 396 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 NR2C1P13056 603 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 IDO1P14902 403 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 RAC2P15153 192 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 BGNP21810 368 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PSMB10P40306 273 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ETV4P43268 484 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 HTR5AP47898 357 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 STX3Q13277 289 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SCARB2Q14108 478 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 LAPTM4AQ15012 233 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 OR8G5Q8NG78 346 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 GTF2H4Q92759 462 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PHF21AQ96BD5 680 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TMEM100Q9NV29 134 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 A0A1W2PRD5 423 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 A0A1W2PRF3 423 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 A0A1W2PRM7 423 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 BIRC5O15392 142 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 ADAM20O43506 726 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 SGCEO43556 437 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TYROBPO43914 113 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 DOK2O60496 412 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 LYPD3O95274 346 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 PAHP00439 452 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 THY1P04216 161 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 HLA-DPB1P04440 258 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 COX5BP10606 129 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 KITP10721 976 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 MSR1P21757 451 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.02□□□□□ -1.45
IGHVII-49-1-201ENST00000521760 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms