RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519885.5

TRAPPC2-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2, human

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC2, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC2-208	ENST00000519885	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PLPP3	O14495	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	WDR1	O75083	606 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	LYPD3	O95274	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	IGHG3	P01860	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TF	P02787	698 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CDK1	P06493	297 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	STS	P08842	583 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TACSTD2	P09758	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CPN1	P15169	458 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CCNA2	P20248	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NPR2	P20594	1047 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NR4A1	P22736	598 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GRPR	P30550	384 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FMO3	P31513	532 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CCL11	P51671	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NUDT6	P53370	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CLDN6	P56747	220 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CARD18	P57730	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR2B6	P58173	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PCBD1	P61457	104 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SLC35A2	P78381	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	HOXC5	Q00444	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	HSF1	Q00613	529 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	EGR4	Q05215	589 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CD47	Q08722	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GPR50	Q13585	617 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	APOF	Q13790	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ICAM4	Q14773	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR7A5	Q15622	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885		Q6ZNX1	250 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	WBP1	Q96G27	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SP140L	Q9H930	580 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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