RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRORYQ9H606 182 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 GIN1Q9NXP7 522 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 DOK5Q9P104 306 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHPKQ9UHJ6 478 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MMP17Q9ULZ9 603 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCL26Q9Y258 94 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CUX2O14529 1486 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CENPFP49454 3210 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLIT2O94813 1529 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 UTRNP46939 3433 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 PXDNLA1KZ92 1463 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0U1RRA0 63 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1B0GVL5 298 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR6C74A6NCV1 312 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 A8MXQ7 604 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MGRN1O60291 552 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 FKBP6O75344 327 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TM7SF2O76062 418 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPN2P04844 631 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CAPN1P07384 714 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTRB1P17538 263 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB3BP20337 219 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCR7P32248 378 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRPHP41219 470 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPBWR2P48146 333 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RFX3P48380 749 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDK16Q00536 496 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCRN3Q0VDG4 424 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MERTKQ12866 999 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 OXA1LQ15070 435 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF77Q15935 545 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 LUZP6Q538Z0 58 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCEAL5Q5H9L2 206 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 LDLRAP1Q5SW96 308 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR52E8Q6IFG1 317 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC25A25Q6KCM7 469 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM159AQ6UWV7 190 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MOB3BQ86TA1 216 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM17Q86X19 198 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MUC15Q8N387 334 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCAIMQ8N3R3 496 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC89Q8N998 374 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACOT4Q8N9L9 421 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2Z1Q8NG97 314 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR10A7Q8NGE5 316 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5L2Q8NGL0 311 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 URGCPQ8TCY9 931 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCEAL3Q969E4 200 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 YIPF5Q969M3 257 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBE2E3Q969T4 207 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 NTAN1Q96AB6 310 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MED8Q96G25 268 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC114Q96M63 670 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPY6RQ99463 290 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 EDEM2Q9BV94 578 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBKSQ9H477 322 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RHOJQ9H4E5 214 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 REEP4Q9H6H4 257 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 VSIRQ9H7M9 311 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 INIPQ9NRY2 104 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RDH8Q9NYR8 311 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMED5Q9Y3A6 229 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLUHO75153 1309 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNF222A6NCQ9 220 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF726A6NNF4 738 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 NVLO15381 856 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCO1O75880 301 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCNK2O95069 426 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 UTS2O95399 124 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 ETHE1O95571 254 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV1-46P01743 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 ETS2P15036 469 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF43P17038 809 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGCP20142 388 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 AHCYP23526 432 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL12AP29459 219 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAS1LP35410 378 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 HCAR3P49019 387 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC26A5P58743 744 aa-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms