RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SPICQ8N5J4 248 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 RASD2Q96D21 266 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 HAVCR1Q96D42 359 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SYT4Q9H2B2 425 aa14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 IMPA2O14732 288 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A7O60669 478 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PTP4A3O75365 173 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 COX4I1P13073 169 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 EGR1P18146 543 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GSK3BP49841 420 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 BTG1P62324 171 aa14.25□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 GUCY1A3Q02108 690 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 AQP6Q13520 282 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ZMYND11Q15326 602 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PTP4A1Q93096 173 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 OR2V2Q96R30 315 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NTN4Q9HB63 628 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 IL19Q9UHD0 177 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.25□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.25□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 OR6C6A6NF89 314 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NDUFB2O95178 105 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NCK1P16333 377 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SDHAP31040 664 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A9P48067 706 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ZNF154Q13106 437 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 AWAT1Q58HT5 328 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 OR5AS1Q8N127 324 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 FAM162AQ96A26 154 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 COG8Q96MW5 612 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 AUP1Q9Y679 476 aa14.24□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SOCS2O14508 198 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 RER1O15258 196 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SURF4O15260 269 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 DBHP09172 617 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 RAC2P15153 192 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.23□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GCM1Q9NP62 436 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ZNF69Q9UC07 566 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NUP50Q9UKX7 468 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.23□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TMEM178BH3BS89 294 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GPANK1O95872 356 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 ZNF12P17014 697 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 MMP16P51512 607 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 FXYD6P3P58550 94 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 FGD3Q5JSP0 725 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
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