RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508124.5

SLC38A9-215, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 2,370 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-215	ENST00000508124	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124		A0A1W2PP11	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	WDR1	O75083	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	GUSB	P08236	651 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SBK2	P0C263	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ACKR3	P25106	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC6A9	P48067	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	RAD23A	P54725	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	UCN	P55089	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	VBP1	P61758	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC35A2	P78381	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	RORB	Q92753	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	FOXB1	Q99853	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124		A0A1B0GW55	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124		J3QRE1	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	PRRG2	O14669	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DHH	O43323	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	RCBTB2	O95199	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	IGHG1	P01857	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	ZNF3	P17036	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	CA7	P43166	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	HSPA13	P48723	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	CHN2	P52757	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	CDC42	P60953	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	TFF3	Q07654	80 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	GPR107	Q5VW38	600 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A9-215	ENST00000508124	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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