RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 C4orf45Q96LM5 186 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SH3GL3Q99963 347 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 C1orf198Q9H425 327 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 C12orf49Q9H741 205 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 FAM206AQ9NX38 181 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MALT1Q9UDY8 824 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 HSPB2A8KAH6 182 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GABRPO00591 440 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PIN1P1O15428 100 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 WDR1O75083 606 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF254O75437 659 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TPOP07202 933 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GLI4P10075 376 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GABRA1P14867 456 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 B4GALT1P15291 398 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 IGHV1-2P23083 117 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 DCTDP32321 178 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TIMP3P35625 211 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 UGT2B10P36537 528 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF84P51523 738 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 CCR9P51686 369 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TAS2R43P59537 309 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SLC3A1Q07837 685 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 FAPQ12884 760 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 KLRB1Q12918 225 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 LY6DQ14210 128 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 HSPB2Q16082 182 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 RDH10Q8IZV5 341 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ABHD4Q8TB40 342 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF75AQ96N20 296 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 DACH2Q96NX9 599 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TMED9Q9BVK6 235 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MROQ9BYG7 248 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 NOX3Q9HBY0 568 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 R4GMQ9 66 aa8.24□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OR6C6A6NF89 314 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SLC22A1O15245 554 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SYNGR3O43761 229 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TMCC2O75069 709 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 TACSTD2P09758 323 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 CD8BP10966 210 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 EDN3P14138 238 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF32P17041 273 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GALP22466 123 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 CRYGSP22914 178 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MPGP29372 298 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PTGER4P35408 488 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MMP16P51512 607 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 PSG4Q00888 419 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 HGFACQ04756 655 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 C22orf42Q6IC83 251 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GFRALQ6UXV0 394 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 KRT77Q7Z794 578 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SYT9Q86SS6 491 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 NAA40Q86UY6 237 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 GJC3Q8NFK1 279 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 SLC7A6Q92536 515 aa8.23□□□□□ -1.09
SEC22C-216ENST00000493107 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms