RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CATSPERDQ86XM0 798 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SLC26A10Q8NG04 563 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR52N5Q8NH56 324 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ASB5Q8WWX0 329 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ST8SIA1Q92185 356 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RADILQ96JH8 1075 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SPSB2Q99619 263 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CENPMQ9NSP4 180 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ETV7Q9Y603 341 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GTQ1 180 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SULT1B1O43704 296 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CELA2AP08217 269 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 FOSL2P15408 326 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 AP3S2P59780 193 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 HSF1Q00613 529 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PHF19Q5T6S3 580 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MISPQ8IVT2 679 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MEIOBQ8N635 442 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NUBPLQ8TB37 319 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 POC1BQ8TC44 478 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 DHDHQ9UQ10 334 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ACOT7O00154 380 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CTAG2O75638 210 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 APOC3P02656 99 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CRABP1P29762 137 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PTGDSP41222 190 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OPCMLQ14982 345 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 METTL11BQ5VVY1 283 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TMEM225Q6GV28 225 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 REG4Q9BYZ8 158 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CHST11Q9NPF2 352 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PNR3 127 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LINC01387J3KSC0 135 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF823P16415 610 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 AKR1D1P51857 326 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 BIDP55957 195 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RAB11BQ15907 218 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR1J4Q8NGS1 313 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MARVELD3Q96A59 401 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 KCNK17Q96T54 332 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MYOTQ9UBF9 498 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 LIPT2A6NK58 231 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 XRCC3O43542 346 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TGM6O95932 706 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 KLK2P20151 261 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SPOCK1Q08629 439 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF273Q14593 569 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TMEM205Q6UW68 189 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ST7LQ8TDW4 575 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MRI1Q9BV20 369 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 GGT3PA6NGU5 568 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ARPC5O15511 151 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PRAF2O60831 178 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CFIP05156 583 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF28P17035 718 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZP4Q12836 540 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MYBPHQ13203 477 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 OR10K2Q6IF99 312 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NPTNQ9Y639 398 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 A0A1B0GUH1 482 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPC1 479 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 HSPB2A8KAH6 182 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 PATE3B3GLJ2 98 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-213ENST00000492657 P2RY10O00398 339 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms