RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 KITLGP21583 273 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ERFP50548 548 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 HIST1H3AP68431 136 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 ACSM5Q6NUN0 579 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB3-211ENST00000490677 HIST2H3AQ71DI3 136 aa23.53■■□□□ 1.36
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HOXB3-211ENST00000490677 RAB39BQ96DA2 213 aa23.52■■□□□ 1.36
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HOXB3-211ENST00000490677 TUBG2Q9NRH3 451 aa23.52■■□□□ 1.36
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HOXB3-211ENST00000490677 CMBLQ96DG6 245 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 TIMD4Q96H15 378 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 OR52D1Q9H346 318 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 ARPC3O15145 178 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 FAHD2AQ96GK7 314 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 IL1RAPQ9NPH3 570 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF283Q8N7M2 679 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 SAMD8Q96LT4 415 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 NPTNQ9Y639 398 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 J3QW42 95 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 LEG1Q6P5S2 330 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 CORO6Q6QEF8 472 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 FBXW12Q6X9E4 464 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 OR2Z1Q8NG97 314 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 PTP4A1Q93096 173 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 NSMCE2Q96MF7 247 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-211ENST00000490677 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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