RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 NELFAQ9H3P2 528 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 AMBNQ9NP70 447 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 EMC7Q9NPA0 242 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 POLE4Q9NR33 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.71□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CIB4A0PJX0 185 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RAD51DO75771 328 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LYZL6O75951 148 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RAB36O95755 333 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GPANK1O95872 356 aa6.7□□□□□ -1.34
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GARNL3-218ENST00000487565 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF823P16415 610 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV1-2P23083 117 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CAPZA2P47755 286 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GABARAPL2P60520 117 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HSF2Q03933 536 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MEP1BQ16820 701 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 NRN1LQ496H8 165 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KLHL22Q53GT1 634 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OTPQ5XKR4 325 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TIGD4Q8IY51 512 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 STX19Q8N4C7 294 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HTRA1Q92743 480 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MYDGFQ969H8 173 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 NABP1Q96AH0 204 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LGALS12Q96DT0 336 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LRRC46Q96FV0 321 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TEAD3Q99594 435 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 COPS4Q9BT78 406 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 WDR76Q9H967 626 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MARCH7Q9H992 704 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SIAEQ9HAT2 523 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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GARNL3-218ENST00000487565 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 DOCK7Q96N67 2140 aa6.7□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PHYHO14832 338 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RGS10O43665 173 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TMCC2O75069 709 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MPZL1O95297 269 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TFP02787 698 aa6.69□□□□□ -1.34
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GARNL3-218ENST00000487565 SBK2P0C263 348 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MYL12AP19105 171 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CRHBPP24387 322 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CD79BP40259 229 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLC15A1P46059 708 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PCBD1P61457 104 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 AQP6Q13520 282 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLC36A2Q495M3 483 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.69□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PRR31Q5SQ13 230 aa6.69□□□□□ -1.34
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