RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		7.23	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	MSL2	Q9HCI7	577 aa		7.23	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		7.23	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		7.23	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	GMNC	A6NCL1	334 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SCG5	P05408	212 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	CST2	P09228	141 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	NR2C1	P13056	603 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	LAP3	P28838	519 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	PCGF2	P35227	344 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	ARHGDIA	P52565	204 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	CRYBA2	P53672	197 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	MTPN	P58546	118 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	PAX8	Q06710	450 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	FMOD	Q06828	376 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	CD47	Q08722	323 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	PSG7	Q13046	419 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	TAF11	Q15544	211 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC80	Q76M96	950 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	PFN4	Q8NHR9	129 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	NSMAF	Q92636	917 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC25A28	Q96A46	364 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SGTB	Q96EQ0	304 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	C4orf45	Q96LM5	186 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SAMD8	Q96LT4	415 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	ALG12	Q9BV10	488 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	MRI1	Q9BV20	369 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	SLITRK2	Q9H156	845 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		7.21	□□□□□ -1.25
UBE2F-222	ENST00000482096	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	OR5F1	O95221	314 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TNFRSF1A	P19438	455 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TUBG1	P23258	451 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TNFSF4	P23510	183 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	GZMM	P51124	257 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	PCBD1	P61457	104 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	BTG1	P62324	171 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	PAX2	Q02962	417 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	ZMYND11	Q15326	602 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF774	Q6NX45	483 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	LEG1	Q6P5S2	330 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	ARL9	Q6T311	187 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096		Q6ZR03	302 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	OR10A6	Q8NH74	314 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	FNDC8	Q8TC99	324 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	RBP7	Q96R05	134 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	ANGPT2	O15123	496 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	ABHD16A	O95870	558 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	PLAT	P00750	562 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	WNT2	P09544	360 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	COX5B	P10606	129 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	THRB	P10828	461 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	GSTM3	P21266	225 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	KITLG	P21583	273 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	CPT2	P23786	658 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	CD80	P33681	288 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	MTNR1A	P48039	350 aa		7.2	□□□□□ -1.26
UBE2F-222	ENST00000482096	TAS2R41	P59536	307 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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