RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 C7orf34Q96L11 122 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 LRR1Q96L50 414 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OXGR1Q96P68 337 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 VCXQ9H320 206 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OR51B6Q9H340 312 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 POLE3Q9NRF9 147 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 RAB26Q9ULW5 256 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.01□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CEACAM18A8MTB9 384 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 G3V2T6 193 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 GNGT2O14610 69 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 UBL3O95164 117 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 SNAP29O95721 258 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV4-59P01825 116 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 LCKP06239 509 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CD55P08174 381 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 NR2F1P10589 423 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 THRBP10828 461 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 IER3P46695 156 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OR1E2P47887 323 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 EGR4Q05215 589 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 EGR3Q06889 387 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CAMK2DQ13557 499 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 HERPUD1Q15011 391 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 LAPTM4AQ15012 233 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 MOGQ16653 247 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 DUSP7Q16829 419 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ESCO2Q56NI9 601 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 BTNL3Q6UXE8 466 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 COMTD1Q86VU5 262 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 SKA3Q8IX90 412 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf174Q8IYL3 243 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OR2T29Q8NH02 315 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 OR5K1Q8NHB7 308 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D15Q8TC07 691 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CFHR4Q92496 578 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ITPKCQ96DU7 683 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CNBD2Q96M20 576 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 FOXB1Q99853 325 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 SMURF2Q9HAU4 748 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 BCL2L10Q9HD36 194 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 EXD2Q9NVH0 621 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFAF4Q9P032 175 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 U3KQV3 271 aa6□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM247A6NEH6 219 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 J3KTA2 159 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 XPNPEP2O43895 674 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 E2F6O75461 281 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 HPRP00739 348 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 IFNA14P01570 189 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ALPLP05186 524 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-DOBP13765 273 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 PRKACGP22612 351 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CPT2P23786 658 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 MPV17P39210 176 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 HSPA13P48723 471 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ALDH3A2P51648 485 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 BTG1P62324 171 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 PMS2P3Q13401 168 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 MED21Q13503 144 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 GPAT3Q53EU6 434 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 GPR157Q5UAW9 335 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CARD17Q5XLA6 110 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.99□□□□□ -1.45
CASQ1-203ENST00000481081 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms