RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPW3 197 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CIB2O75838 187 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 LY6G6DO95868 133 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DQA2P01906 255 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CSF3P09919 207 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 POU1F1P28069 291 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GRK5P34947 590 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MPV17P39210 176 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A1P53007 311 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SPATA46Q5T0L3 261 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SLC18B1Q6NT16 456 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ACSM5Q6NUN0 579 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 LINC00346Q8IVM7 164 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ATG16L2Q8NAA4 619 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 PROKR2Q8NFJ6 384 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 OR51L1Q8NGJ5 315 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 OR5K1Q8NHB7 308 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 OR2J1Q9GZK6 312 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 TPK1Q9H3S4 243 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ZNF556Q9HAH1 456 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL3Q9HB03 270 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ATPIF1Q9UII2 106 aa17.94■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 IFNGP01579 166 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-13P01766 116 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SPI1P17947 270 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 PDLIM4P50479 330 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SELENOVP59797 346 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 PPP1CBP62140 327 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GINS1Q14691 196 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ZNF718Q3SXZ3 478 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 TMEM255AQ5JRV8 349 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ELFN2Q5R3F8 820 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 FAHD1Q6P587 224 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 LYPD4Q6UWN0 246 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CLEC9AQ6UXN8 241 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 C1orf174Q8IYL3 243 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 TBCCD1Q9NVR7 557 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.93■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 TVP23AA6NH52 213 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 RIIAD1A6NNX1 92 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 EBAG9O00559 213 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ABHD16AO95870 558 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GYPBP06028 91 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 DBHP09172 617 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CLUP10909 449 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 NAT2P11245 290 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A16P16260 332 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 FASP25445 335 aa17.92■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 NKPD1Q17RQ9 610 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 SLC27A4Q6P1M0 643 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ARL9Q6T311 187 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 COQ7Q99807 217 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CDADC1Q9BWV3 514 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HCAR1Q9BXC0 346 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 POFUT1Q9H488 388 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 KCNG2Q9UJ96 466 aa17.92■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 VWC2LB2RUY7 222 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 DAOP14920 347 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ZNF823P16415 610 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 ZNF3P17036 446 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 GCH1P30793 250 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CDK5Q00535 292 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CFAP77Q6ZQR2 320 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 AMIGO2Q86SJ2 522 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HIPK1Q86Z02 1210 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 PTP4A1Q93096 173 aa17.91■□□□□ 0.46
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ACTB-211ENST00000480301 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 STARD10Q9Y365 291 aa17.91■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 FAM183AA6NL82 134 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 C17orf100A8MU93 164 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 NDUFS8O00217 210 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HPXP02790 462 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 HEXAP06865 529 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 PSKH1P11801 424 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 RPS27P42677 84 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP1-1Q07627 177 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 CARTPTQ16568 116 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 MOGQ16653 247 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 LINC01590Q5TEZ4 76 aa17.9■□□□□ 0.46
ACTB-211ENST00000480301 Q71RC1 249 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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