RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477087.1

CDKN1B-204, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

TSL 3

Gene CDKN1B, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1B-204ENST00000477087 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TUBA1AQ71U36 451 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MDGA2Q7Z553 956 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 BEST3Q8N1M1 668 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MDS2Q8NDY4 140 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR2T4Q8NH00 348 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR6X1Q8NH79 312 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF519Q8TB69 540 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PHYHIPQ92561 330 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 RNFT2Q96EX2 444 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OXGR1Q96P68 337 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MGLLQ99685 303 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ALG12Q9BV10 488 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 RNF122Q9H9V4 155 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 AMBNQ9NP70 447 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CHST11Q9NPF2 352 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 AASSQ9UDR5 926 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ENPP5Q9UJA9 477 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.13□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 DMDP11532 3685 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 LAMA1P25391 3075 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 A0A1W2PRG6 482 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR2M5A3KFT3 312 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PRSS37A4D1T9 235 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR6C68A6NDL8 312 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CCDC182A6NF36 153 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CCRL2O00421 344 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PHYHO14832 338 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC22A1O15245 554 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PLPP2O43688 288 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 NME2P1O60361 137 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 SULT1C4O75897 302 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 SLC2A10O95528 541 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PPP1R3DO95685 299 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 WDPCPO95876 746 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ACTL6AO96019 429 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 RENP00797 406 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ADORA3P0DMS8 318 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 SPI1P17947 270 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CCNA2P20248 432 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 DCTDP32321 178 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TNFSF10P50591 281 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 WNT4P56705 351 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TAS2R43P59537 309 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 FOXF1Q12946 379 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MYBPHQ13203 477 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CRMP1Q14194 572 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TRAM1Q15629 374 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 NEDD8Q15843 81 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ACKR1Q16570 336 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CTF1Q16619 201 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 HIST3H3Q16695 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TIGD6Q17RP2 521 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 THEM4Q5T1C6 240 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TEX19Q8NA77 164 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 OR2M7Q8NG81 312 aa5.12□□□□□ -1.59
CDKN1B-204ENST00000477087 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms