RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	CA7	P43166	264 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TUBA4A	P68366	448 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SIRPA	P78324	504 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC35A2	P78381	396 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PMPCA	Q10713	525 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	IL18R1	Q13478	541 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	AQP6	Q13520	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	COG8	Q96MW5	612 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SPTA1	P02549	2419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF726	A6NNF4	738 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268		E9PLN8	166 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268		M0R3G1	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	XKRY	O14609	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GPR171	O14626	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LRRTM2	O43300	516 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC16A7	O60669	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MPZL1	O95297	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	IGHG1	P01857	330 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	QDPR	P09417	244 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF3	P17036	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GNLY	P22749	145 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PYCR1	P32322	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RBPJ	Q06330	500 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CDSN	Q15517	529 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GGH	Q92820	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TEAD3	Q99594	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RERGL	Q9H628	205 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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