RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	C4orf45	Q96LM5	186 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DOK1	Q99704	481 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMEM129	A0AVI4	362 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TRIM64B	A6NI03	449 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ABHD16A	O95870	558 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ADRA2A	P08913	450 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SPI1	P17947	270 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	WNT5A	P41221	380 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A1	P53007	311 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CRISP1	P54107	249 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CDK5	Q00535	292 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PITX2	Q99697	317 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	NF1	P21359	2839 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902		M0R233	179 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SYNGR3	O43761	229 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	LY6H	O94772	140 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CLPTM1	O96005	669 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SPARC	P09486	303 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GCH1	P30793	250 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ALDH3B1	P43353	468 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	EVX1	P49640	407 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PPOX	P50336	477 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	EFNA4	P52798	201 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF511	Q8NB15	262 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PKP2	Q99959	881 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TPK1	Q9H3S4	243 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		15.25	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR6C6	A6NF89	314 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902		H7C1Q1	480 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SURF4	O15260	269 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	NGF	P01138	241 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	DBH	P09172	617 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	IGFBP5	P24593	272 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GGT2	P36268	569 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PPP1CB	P62140	327 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SNAPC1	Q16533	368 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CARTPT	Q16568	116 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	KLHL12	Q53G59	568 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PARP8	Q8N3A8	854 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	WDR76	Q9H967	626 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	GPR160	Q9UJ42	338 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		15.24	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902		H3BNX3	289 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF250	P15622	560 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	BLVRA	P53004	296 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ESRRG	P62508	458 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H3A	P68431	136 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	TNK1	Q13470	666 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	CPO	Q8IVL8	374 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF525	Q8N782	197 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	SNX33	Q8WV41	574 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	PTP4A1	Q93096	173 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	COQ7	Q99807	217 aa		15.23	■□□□□ 0.03
USP19-210	ENST00000465902	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		15.23	■□□□□ 0.03

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