RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 NUS1Q96E22 293 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF2Q99496 336 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DOK1Q99704 481 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 EBF4Q9BQW3 602 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC35A5Q9BS91 424 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DPH7Q9BTV6 452 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 APOOQ9BUR5 198 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DDA1Q9BW61 102 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DUSP16Q9BY84 665 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CSTL1Q9H114 145 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CXXC4Q9H2H0 198 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MIXL1Q9H2W2 232 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 REEP4Q9H6H4 257 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A19Q9HC21 320 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 POLE4Q9NR33 117 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC17A7Q9P2U7 560 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 FLVCR2Q9UPI3 526 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MOKQ9UQ07 419 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 PEX16Q9Y5Y5 336 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SBF2Q86WG5 1849 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MYH1P12882 1939 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa2.95□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A0A6YYD4 124 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1B0GUH1 482 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1W2PS18 150 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 FABP12A6NFH5 140 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 F5H6K3 240 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SMLR1H3BR10 107 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 BCKDKO14874 412 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CASKO14936 926 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MSH4O15457 936 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 TAPBPO15533 448 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CHST10O43529 356 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RAMP3O60896 148 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 UGT2B11O75310 529 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 UGT2B17O75795 530 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 OR2B3O76000 313 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 AP2A2O94973 939 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 OR2F2O95006 317 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 IGSF6O95976 241 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MYOGP15173 224 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF30P17039 623 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB3BP20337 219 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 GSTM3P21266 225 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CD80P33681 288 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ARR3P36575 388 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MAGEA5P43359 124 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 OR3A2P47893 321 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 TGM4P49221 684 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 CCR8P51685 355 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 XKP51811 444 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 FUT6P51993 359 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 LBX1P52954 281 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP1B3P54709 279 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 PLP1P60201 277 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 IRF8Q02556 426 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 GNA12Q03113 381 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 KLRC3Q07444 240 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC10A7Q0GE19 358 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR17Q13304 367 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 NFATC4Q14934 902 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 OR8G1Q15617 311 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF74Q16587 644 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 VPS26BQ4G0F5 336 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 SPANXN4Q5MJ08 99 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DCST2Q5T1A1 773 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 DCAF12Q5T6F0 453 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 GPRC6AQ5T6X5 926 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 LPCAT4Q643R3 524 aa2.94□□□□□ -1.94
ANKRD28-205ENST00000460278 REP15Q6BDI9 236 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms