RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 AGAP4Q96P64 663 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 FAM206AQ9NX38 181 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 HHLA2Q9UM44 414 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CARD18P57730 90 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK15Q9H427 330 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF292O60281 2723 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 MEIOCA2RUB1 952 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CXCL13O43927 109 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CD2P06729 351 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 RAC3P60763 192 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 GABREP78334 506 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 YIPF5Q969M3 257 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ABCG5Q9H222 651 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 AUNIPQ9H7T9 357 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ITGA5P08648 1049 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A1P11166 492 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CASRP41180 1078 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 MMP16P51512 607 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 PRKXP51817 358 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 GPR176Q14439 515 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 OR1C1Q15619 314 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 PLET1Q6UQ28 207 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM123Q8N131 208 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 RNF121Q9H920 327 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0B4J293 547 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CALCBP10092 127 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 MMP15P51511 669 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN15P56746 228 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 POU4F3Q15319 338 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 LINGO2Q7L985 606 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 OR2M7Q8NG81 312 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CKLFQ9UBR5 152 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 TTRP02766 147 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CELA3AP09093 270 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ACSM4P0C7M7 580 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 FAM157BP0CG42 384 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 HSD11B1P28845 292 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 NR4A2P43354 598 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 PITPNAQ00169 270 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 SLC36A2Q495M3 483 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 OR10D3Q8NH80 312 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 THRSPQ92748 146 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.53■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 A6NL46 340 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF878C9JN71 531 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 PTHLHP12272 177 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ACHEP22303 614 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ANOS1P23352 680 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 TAF13Q15543 124 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 GLRX5Q86SX6 157 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM54Q969K7 222 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF407Q9C0G0 2248 aa20.52■□□□□ 0.88
FAAP20-209ENST00000428120 ISG15P05161 165 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 NTF4P34130 210 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ART1P52961 327 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SULF2Q8IWU5 870 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC18Q8N456 261 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 UPRTQ96BW1 309 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 CMTM3Q96MX0 182 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ABI3Q9P2A4 366 aa20.52■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC13O75165 2243 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 FAM166BA8MTA8 275 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 CDK2P24941 298 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 DDOSTP39656 456 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 SPOCK1Q08629 439 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 LUZP2Q86TE4 346 aa20.51■□□□□ 0.87
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms