RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACP1P24666 158 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNASE1L1P49184 302 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST3GAL2Q16842 350 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf183Q5T699 404 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf198Q9H425 327 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROK2Q9HC23 129 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIABLOQ9NR28 239 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC17A5Q9NRA2 495 aa16.65■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED12Q93074 2177 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CIB4A0PJX0 185 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B4E171 279 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RY10O00398 339 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF43P17038 809 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR2CP28335 458 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN7P41732 249 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35A1P78382 337 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFAP5Q13361 173 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD17Q5XLA6 110 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH24Q86UP0 819 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BEST4Q8NFU0 473 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEAL3Q969E4 200 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH2D2AQ9NP31 389 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.64■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LMX1BO60663 402 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM4BO94953 1096 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS19P49795 217 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP77Q6ZQR2 320 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTNG2Q96CW9 530 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNRHR2Q96P88 292 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMC7Q9NPA0 242 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLVCR2Q9UPI3 526 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEGF11A6BM72 1044 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H7C417 338 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MASP2O00187 686 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTRP02766 147 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDOBP05062 364 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSM4P0C7M7 580 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIFP15018 202 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGD2Q7Z6J4 655 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM156Q8N614 296 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6M1Q8NGM8 313 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BEX1Q9HBH7 125 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STMN3Q9NZ72 180 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 G3V3Y1 287 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FABP7O15540 132 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMS2P2O95744 297 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCL3P19876 107 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDAP32320 146 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLF1P58340 268 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPOCK1Q08629 439 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOMM20Q15388 145 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIST3H3Q16695 136 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF222Q9UK12 451 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.62■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBBP9O75884 186 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA3P12429 323 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VEGFCP49767 419 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYLS1Q96M11 299 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10A4Q9H209 315 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPF1Q9NWY4 346 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMC3Q9P0I2 261 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF726A6NNF4 738 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK17BO94768 372 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3F3AP84243 136 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALK2Q01415 458 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00303Q3SY05 128 aa16.61■□□□□ 0.25
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms