RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.04□□□□□ -0.64
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C1C5 153 aa11.04□□□□□ -0.64
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPANK1O95872 356 aa11.04□□□□□ -0.64
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.03□□□□□ -0.64
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5AS1Q8N127 324 aa11.02□□□□□ -0.65
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTP4A1Q93096 173 aa11.02□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM165Q9HC07 324 aa11.02□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9A3P48764 834 aa11.01□□□□□ -0.65
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OAFQ86UD1 273 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A6Q92536 515 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.01□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GUS0 222 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C6A6NF89 314 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTLA4P16410 223 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUT4P22083 530 aa11□□□□□ -0.65
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB112Q30KQ8 113 aa11□□□□□ -0.65
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