RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417905.1

RBM5-204, Transcript of RNA binding motif protein 5, human

TSL 5

Gene RBM5, Length 427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM5-204	ENST00000417905	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SERPINI2	O75830	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	GABARAP	O95166	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CPE	P16870	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MSR1	P21757	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SHC1	P29353	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	GABRA5	P31644	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CCR9	P51686	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CLDN17	P56750	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ADAM8	P78325	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	KLRB1	Q12918	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ECH1	Q13011	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	FOXE3	Q13461	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	AQP6	Q13520	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TPBG	Q13641	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MELK	Q14680	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SP140L	Q9H930	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MED29	Q9NX70	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	PLPP2	O43688	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CDC14B	O60729	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	KRT33A	O76009	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	INMT	O95050	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	PTH	P01270	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	AMY2A	P04746	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CST2	P09228	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	QDPR	P09417	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CTLA4	P16410	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CD36	P16671	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	AMY2B	P19961	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	TIMP3	P35625	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	RFC3	P40938	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	STAR	P49675	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ETV1	P50549	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM5-204	ENST00000417905	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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