RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GDF1P27539 372 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABRA5P31644 462 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD79BP40259 229 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BLVRAP53004 296 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC16A1P53985 500 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAS2R43P59537 309 aa8.35□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.35□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.35□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR6V1Q8N148 313 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.35□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASB10Q8WXI3 467 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UFD1Q92890 307 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.35□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNRHR2Q96P88 292 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALG12Q9BV10 488 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.35□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FREM3P0C091 2139 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VWFP04275 2813 aa8.35□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2M5A3KFT3 312 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AQP7P3A6NL99 342 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C11orf98E9PRG8 122 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.34□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACTG1P63261 375 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC35A1P78382 337 aa8.34□□□□□ -1.07
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SOX9-AS1-201ENST00000412640 BEX5Q5H9J7 111 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CENPOQ9BU64 300 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DKKL1Q9UK85 242 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SSR3Q9UNL2 185 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B9D1Q9UPM9 204 aa8.34□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED12Q93074 2177 aa8.34□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RYR3Q15413 4870 aa8.34□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GJE1A6NN92 205 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VGLL3A8MV65 326 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CENPBD1B2RD01 187 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C16orf97H3BN30 126 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01387J3KSC0 135 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMPRSS2O15393 492 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OGG1O15527 345 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLPP2O43688 288 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFSF13O75888 250 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKR7A3O95154 331 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VENTXO95231 258 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLA-DPB1P04440 258 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THBDP07204 575 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HLA-DOBP13765 273 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHC1P29353 583 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PYCR1P32322 319 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINB10P48595 397 aa8.33□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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