RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 NDUFB6O95139 128 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CT45A8P0DMV1 189 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CT45A9P0DMV2 189 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CD1CP29017 333 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CTHP32929 405 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 TLE3Q04726 772 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 DHRS2Q13268 280 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 MLC1Q15049 377 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 MIB2Q96AX9 1013 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 CST11Q9H112 138 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 SEC14L5O43304 696 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 EFEMP2O95967 443 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SLC35E2P0CK97 266 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 ALOX5APP20292 161 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 OPRM1P35372 400 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 KIR3DL2P43630 455 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 EMP2P54851 167 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 BIDP55957 195 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 ZNF117Q03924 483 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 TMEM225Q6GV28 225 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 FAM57BQ71RH2 274 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 DYRK2Q92630 601 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 FGF11Q92914 225 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SLAMF9Q96A28 289 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 TOX2Q96NM4 488 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 LRP12Q9Y561 859 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.5□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 ZNF208O43345 1280 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 STK17BO94768 372 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 EDN3P14138 238 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 AMY2BP19961 511 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 BDKRB2P30411 391 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CLDN6P56747 220 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 PRPS1P60891 318 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 DYRK1AQ13627 763 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 NEK7Q8TDX7 302 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CCDC107Q8WV48 283 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 OR5B2Q96R09 309 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 MMP25Q9NPA2 562 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.5□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 EPOPA6NHQ4 379 aa7.49□□□□□ -1.21
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SNX13-201ENST00000409076 GABRA1P14867 456 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SDHAP31040 664 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CD96P40200 585 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 SHHQ15465 462 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 ZNF626Q68DY1 528 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 UBALD1Q8TB05 177 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 UBQLN4Q9NRR5 601 aa7.49□□□□□ -1.21
SNX13-201ENST00000409076 CTSFQ9UBX1 484 aa7.49□□□□□ -1.21
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